جامعة "أون" تأسست من حوالي 5000 سنة مضت، وكانت ذات شهرة واسعة ومركز مهم للمعرفة والتعلم، خصوصا في علم الفلك وهندسة والطب، ربما كانت المثال المتقن للمعرفة والمهارة في معلمين "أون" هو "أمحتوب" الكاهن الرئيسي والوزير والمصمم الذي كان منذ 2700 قبل الميلاد حيث صمم أول التراكيب الكبيرة للحجارة، وعَرفَ في التاريخ باسم "زوسر" في "سقارة". يُصرّحُ ورق البردي " Westcar" أيضا بأن مؤسس السلالة الخامسة كان خوري جامعة "أون" قبل اعتلاء العرش. ويعد الإنجاز الاكثر اهمية لجامعة "أون" هو النداء لعبادة الاله الوحيد، القرص الشمسي "لآتون"، على يدي "اخناتون" الذي نادى بأفكار كهنة "أون".
شعار الجامعةِ، المسلّه والصقران، يوضح الشعار مدى الترابط بين الإسم والتاريخ القديم للجامعه. وتمثل المسله بيت الحياة في مدينة أون، بينما يرمز الصقران إلى الإله المصري في ذلك الوقت، إن الجامعة حاليا تقع في منطقة قصر الزعفران، الذي بني اثناء حكم الخديوي اسماعيل، وسمى القصر بهذا الاسم لأن المنطقة المحيطة به كانت مشهورة بمزارع الزعفران.
جامعة عين شمس تشمل سبعة أحرم جامعية، جميعها محددة في القاهرة. إدارة الجامعةَ، كلية الآداب والحقوق والعلوم، كلهم موجودين في الحرم الجامعي الرئيسي في شارع الخليفة المأمون، العباسية. ان كليات التجارة، الألسن، الصيدلة، طب الأسنان، حاسبات ومعلومات، كلية الطفولة، معهد الدراسات العليا للبيئة سويا مع المستشفى التخصصي يقعون في الحرم الجامعي الثاني على الجانب الآخر من الشارع المذكور أعلاه. كلية الطب وكلية التمريض سويا في مستشفيات الجامعة الواقعة في الحرم الجامعي الثالث في العباسية. كلية الهندسة، التربية النوعية والتربية والبنات والزراعة واقعة كُلّ على حدا في حرم جامعي في العباسية، هليوبوليس، شبرا الخيمة على التوالي
